Інформація

2.7: Регуляція транскрипції: Термінація транскрипції, оперон trp - Біологія

2.7: Регуляція транскрипції: Термінація транскрипції, оперон trp - Біологія


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Завершення транскрипції у прокаріотів

  • Оскільки ділянки, що кодують білок, розташовані в геномах мікроорганізмів, незалежний контроль над сусідніми генами можливий лише за умови сайт припинення транскрипції лежить між ними (тобто гени за течією повинні регулюватися незалежно).
  • Існує два загальних механізми припинення транскрипції:
  1. один вимагає присутності білка термінації транскрипції, званого rho,
  2. інший не потребує пов'язаних білків.

Ро-незалежне припинення

  • Ро-незалежні послідовності припинення транскрипції мають дві загальні характерні ознаки:
  1. 3' відрізок T-залишків
  2. Перерваний паліндром із 'GC' багатий прямо вище за течією від 3'-поліТ-області.

Рисунок 2.7.1: Rho-незалежний сайт термінації транскрипції

Важливими ознаками Rho-незалежної термінації транскрипції є наступні:

  1. Обернена область повторення може самогібридизуватись, утворюючи структуру "стовбурова петля":

Малюнок 2.7.2: Будова стовбурової петлі

2. Богата на GC структура стовбурової петлі взаємодіє з РНК-полімеразою, щоб викликати її паузу.

3. Коротка область UUU, яка є спарюванням основ з послідовністю AAA на антисмисловій нитці ДНК, має низьку термічну стабільність і плавиться, вивільняючи зароджуваний транскрипт РНК.

Ослаблення на опероні trp і передчасне припинення ланцюга мРНК

  • Файл trp оперон регулюється trp репресорний білок.
    • Trp білок -репресор зв'язується з триптофаном і зазнає конформаційної зміни, яка дозволяє йому зв'язуватися з trp область оператора (вниз за промотором).
    • Це перешкоджає транскрипції trp оперон у присутність триптофану (тобто триптофан пригнічує експресію).
    • Однак репресії дещо неповні і існує другий механізм, який сприяє репресії транскрипції.
  • Коли триптофан присутній, а оперон пригнічений, насправді зроблено декілька стенограм досить короткий і не охоплюють всього поліцистронного повідомлення trp оперон.
  • Вироблена коротка мРНК містить лише область, звану лідерну послідовність:

Малюнок 2.7.3: Послідовність лідерів

  • Регіон -лідер містить атенюатор послідовність - сайт, де робиться вибір між подовження зростаючого trp стенограма або (передчасне) припинення.
  • Загасання залежить від взаємодії між зв'язування рибосом і трансляції зароджується транскрипту мРНК і утворення окр стеблево-петльова структура в лідерній послідовності мРНК.
    • Формування цієї структури залежить від швидкості рибосомної трансляції лідерної послідовності (ведуча послідовність містить стартовий кодон AUG).
    • Ефективна трансляція лідерної послідовності залежить від концентрації заряджених тРНК для відповідних амінокислот, кодованих лідерною послідовністю мРНК.
  • Лідерська послідовність має такі характеристики:
  1. Він містить сайт зв'язування рибосом і стартовий кодон AUG, необхідний для ініціації трансляції.
  2. Відповідна амінокислотна послідовність, кодована лідерною послідовністю, містить кілька залишки триптофану.
  3. Він містить декілька перевернуті послідовності повторів таким, що мРНК може прийняти різні альтернативні структури.
  4. Одна з цих структур являє собою a rho-незалежний сайт припинення.

Рисунок 2.7.4: Високий і низький рівень триптофану

В умовах низького вмісту триптофану

  • А. рибосома перекладаючи зароджується trp поліцистронна мРНК кіоски на кодонах триптофану в лідерній послідовності мРНК.
    • Це запобігає сегменти 1 і 2 зароджуваної мРНК формують потенційну структуру стовбурової петлі та звільняють сегмент 2 для формування структури стовбурової петлі з сегментом 3.
    • У цьому випадку зароджувальна транскрипція може протікати до кінця, транскрибуючи всю trp оперон.

В умовах високого вмісту триптофану

  • А. рибосома переклад зароджується trp Поліцистронна мРНК робить ні стійло на сегменті 1 (область з кодонами, що кодують триптофан).
    • У цьому випадку стовбурово-петлева структура між 1 і 2 є не перешкоджає утворенню, і, таким чином, стовбурово-петельна структура Може утворитися 3-4.
    • Ця структура петлі стебла по суті є а rho-незалежна структура припинення транскрипції.
    • РНК -полімераза, що транскрибує повідомлення, що зароджується, припиниться.

Ро-залежне припинення транскрипції

  • Близько половини сайтів припинення в Росії Кишкова паличка потрібен допоміжний білок, який називається rho -фактор.
  • Багато rho-залежні сайти були охарактеризовані з Кишкова паличка та явної схожості послідовності немає.
  • Rho асоціюється з зароджується транскриптом РНК, і ця взаємодія активує активність АТФази, яка, здається, дозволяє rho до перемістити вздовж мРНК в Напрямок 3 '.
    • Може бути так, що якщо РНК -полімераза паузи, rho може наздогнати і викликати термінацію (тобто видалити РНК -полімеразу з матриці ДНК?).
    • Вважається, що пауза РНК-полімерази є важливим механізмом ро-залежної термінації транскрипції.


Подивіться відео: Лактозный оперон (Листопад 2022).